当商品はW（2枚重ね）タイプのトイレットペーパーで、確かにミシン目がずれていて使いにくい状態になっていました。

ただし、2枚重ねの1枚を1周分めくるとミシン目が揃いました。使っているうちに1枚だけ、無意識にめくってしまったものと考えられます。
ミシン目はジャンボロール原紙2つを合わせ、小巻きロール（商品一歩手前の幅の長いロール）にする時に同時に入りますので、基本的には大きくずれることはありません。
同様のお申し出はWタイプのトイレットペーパーでたびたびある事例です。また、1枚の表面に絵柄がついているロールでは、絵柄が見えないというお申し出もあります。
多くの2枚重ねのトイレットペーパーは、このような時の対処法（1枚めくる）を記してあります。今回の商品にも記してありました。
お申し出どおり、ミシン目がずれると使いにくいので、おかしいなと思ったら、1枚だけめくってみてくださいね。